Protein–RNA interactions for Protein: P14854

COX6B1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B1P14854 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms