Protein–RNA interactions for Protein: P14854

COX6B1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B1P14854 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX6B1P14854 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX6B1P14854 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX6B1P14854 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX6B1P14854 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX6B1P14854 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms