Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-EP13747 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-EP13747 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-EP13747 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HLA-EP13747 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms