Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT5P13647 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT5P13647 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT5P13647 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT5P13647 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT5P13647 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT5P13647 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT5P13647 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT5P13647 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT5P13647 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT5P13647 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT5P13647 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT5P13647 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT5P13647 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT5P13647 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT5P13647 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT5P13647 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT5P13647 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT5P13647 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT5P13647 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT5P13647 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT5P13647 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT5P13647 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT5P13647 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT5P13647 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT5P13647 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT5P13647 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT5P13647 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT5P13647 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT5P13647 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT5P13647 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT5P13647 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT5P13647 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT5P13647 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT5P13647 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT5P13647 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT5P13647 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT5P13647 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT5P13647 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT5P13647 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT5P13647 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT5P13647 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT5P13647 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT5P13647 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT5P13647 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT5P13647 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT5P13647 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT5P13647 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT5P13647 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT5P13647 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT5P13647 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT5P13647 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT5P13647 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT5P13647 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT5P13647 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT5P13647 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT5P13647 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT5P13647 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT5P13647 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT5P13647 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT5P13647 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT5P13647 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT5P13647 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT5P13647 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT5P13647 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT5P13647 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT5P13647 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT5P13647 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT5P13647 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT5P13647 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT5P13647 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT5P13647 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT5P13647 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT5P13647 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT5P13647 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT5P13647 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT5P13647 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT5P13647 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT5P13647 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT5P13647 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT5P13647 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT5P13647 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT5P13647 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT5P13647 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT5P13647 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT5P13647 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT5P13647 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT5P13647 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT5P13647 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT5P13647 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT5P13647 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT5P13647 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT5P13647 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT5P13647 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT5P13647 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT5P13647 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT5P13647 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT5P13647 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT5P13647 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT5P13647 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms