Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCANP13611 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCANP13611 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCANP13611 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VCANP13611 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCANP13611 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VCANP13611 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VCANP13611 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VCANP13611 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCANP13611 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCANP13611 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCANP13611 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCANP13611 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCANP13611 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCANP13611 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCANP13611 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCANP13611 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCANP13611 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCANP13611 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCANP13611 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCANP13611 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCANP13611 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VCANP13611 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VCANP13611 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VCANP13611 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCANP13611 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCANP13611 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VCANP13611 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCANP13611 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCANP13611 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCANP13611 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCANP13611 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCANP13611 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCANP13611 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCANP13611 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCANP13611 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCANP13611 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCANP13611 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCANP13611 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VCANP13611 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
VCANP13611 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VCANP13611 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
VCANP13611 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VCANP13611 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VCANP13611 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCANP13611 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCANP13611 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VCANP13611 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCANP13611 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCANP13611 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCANP13611 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VCANP13611 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCANP13611 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VCANP13611 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VCANP13611 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VCANP13611 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VCANP13611 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VCANP13611 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCANP13611 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VCANP13611 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCANP13611 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCANP13611 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VCANP13611 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VCANP13611 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCANP13611 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCANP13611 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCANP13611 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VCANP13611 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VCANP13611 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VCANP13611 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCANP13611 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCANP13611 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCANP13611 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCANP13611 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VCANP13611 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCANP13611 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCANP13611 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCANP13611 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCANP13611 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCANP13611 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCANP13611 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCANP13611 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VCANP13611 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCANP13611 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCANP13611 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VCANP13611 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCANP13611 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VCANP13611 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCANP13611 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCANP13611 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCANP13611 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCANP13611 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCANP13611 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms