Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC45.9■■■■■ 4.94
CFTRP13569 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
CFTRP13569 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
CFTRP13569 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
CFTRP13569 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
CFTRP13569 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
CFTRP13569 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CFTRP13569 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CFTRP13569 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
CFTRP13569 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CFTRP13569 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
CFTRP13569 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
CFTRP13569 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
CFTRP13569 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CFTRP13569 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CFTRP13569 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
CFTRP13569 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CFTRP13569 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CFTRP13569 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CFTRP13569 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CFTRP13569 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CFTRP13569 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CFTRP13569 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CFTRP13569 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CFTRP13569 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CFTRP13569 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
CFTRP13569 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
CFTRP13569 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CFTRP13569 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CFTRP13569 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
CFTRP13569 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
CFTRP13569 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CFTRP13569 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CFTRP13569 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.91
CFTRP13569 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CFTRP13569 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CFTRP13569 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CFTRP13569 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CFTRP13569 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
CFTRP13569 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CFTRP13569 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CFTRP13569 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CFTRP13569 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CFTRP13569 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CFTRP13569 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CFTRP13569 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
CFTRP13569 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
CFTRP13569 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CFTRP13569 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
CFTRP13569 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CFTRP13569 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CFTRP13569 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CFTRP13569 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
CFTRP13569 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CFTRP13569 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
CFTRP13569 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
CFTRP13569 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CFTRP13569 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
CFTRP13569 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CFTRP13569 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CFTRP13569 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
CFTRP13569 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CFTRP13569 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CFTRP13569 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CFTRP13569 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CFTRP13569 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC45.53■■■■■ 4.88
CFTRP13569 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CFTRP13569 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CFTRP13569 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CFTRP13569 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CFTRP13569 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
CFTRP13569 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CFTRP13569 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CFTRP13569 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
CFTRP13569 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CFTRP13569 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CFTRP13569 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
CFTRP13569 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
CFTRP13569 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CFTRP13569 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC45.44■■■■■ 4.87
CFTRP13569 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CFTRP13569 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CFTRP13569 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CFTRP13569 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CFTRP13569 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CFTRP13569 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CFTRP13569 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
CFTRP13569 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CFTRP13569 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CFTRP13569 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CFTRP13569 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CFTRP13569 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
CFTRP13569 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
CFTRP13569 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.38■■■■■ 4.86
CFTRP13569 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CFTRP13569 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CFTRP13569 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CFTRP13569 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CFTRP13569 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CFTRP13569 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms