Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
MS4A1P11836 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MS4A1P11836 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MS4A1P11836 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MS4A1P11836 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MS4A1P11836 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MS4A1P11836 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MS4A1P11836 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
MS4A1P11836 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
MS4A1P11836 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MS4A1P11836 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MS4A1P11836 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms