Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK4P11802 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK4P11802 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK4P11802 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK4P11802 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK4P11802 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK4P11802 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK4P11802 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK4P11802 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK4P11802 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK4P11802 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK4P11802 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK4P11802 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK4P11802 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK4P11802 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK4P11802 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK4P11802 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK4P11802 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK4P11802 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK4P11802 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK4P11802 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK4P11802 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK4P11802 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK4P11802 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK4P11802 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK4P11802 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK4P11802 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK4P11802 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK4P11802 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK4P11802 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK4P11802 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK4P11802 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK4P11802 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK4P11802 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK4P11802 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK4P11802 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK4P11802 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK4P11802 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK4P11802 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK4P11802 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK4P11802 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK4P11802 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK4P11802 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK4P11802 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK4P11802 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK4P11802 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK4P11802 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK4P11802 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK4P11802 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK4P11802 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK4P11802 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK4P11802 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK4P11802 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK4P11802 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK4P11802 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK4P11802 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK4P11802 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK4P11802 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK4P11802 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK4P11802 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK4P11802 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK4P11802 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK4P11802 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK4P11802 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK4P11802 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK4P11802 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK4P11802 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK4P11802 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK4P11802 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK4P11802 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK4P11802 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK4P11802 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK4P11802 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK4P11802 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK4P11802 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK4P11802 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK4P11802 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK4P11802 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK4P11802 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK4P11802 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK4P11802 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK4P11802 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK4P11802 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK4P11802 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK4P11802 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK4P11802 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK4P11802 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK4P11802 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms