Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD28P10747 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD28P10747 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD28P10747 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD28P10747 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD28P10747 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD28P10747 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD28P10747 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD28P10747 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD28P10747 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD28P10747 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD28P10747 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD28P10747 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD28P10747 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD28P10747 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD28P10747 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD28P10747 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD28P10747 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD28P10747 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD28P10747 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD28P10747 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD28P10747 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD28P10747 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD28P10747 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD28P10747 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD28P10747 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CD28P10747 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD28P10747 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD28P10747 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD28P10747 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD28P10747 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD28P10747 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD28P10747 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD28P10747 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD28P10747 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD28P10747 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD28P10747 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD28P10747 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD28P10747 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD28P10747 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD28P10747 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD28P10747 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD28P10747 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD28P10747 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD28P10747 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD28P10747 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD28P10747 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD28P10747 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD28P10747 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD28P10747 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD28P10747 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD28P10747 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD28P10747 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD28P10747 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD28P10747 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD28P10747 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD28P10747 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD28P10747 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD28P10747 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD28P10747 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD28P10747 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD28P10747 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD28P10747 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD28P10747 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD28P10747 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD28P10747 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD28P10747 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD28P10747 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD28P10747 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD28P10747 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD28P10747 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD28P10747 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD28P10747 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD28P10747 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD28P10747 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD28P10747 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD28P10747 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD28P10747 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD28P10747 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD28P10747 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD28P10747 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD28P10747 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD28P10747 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms