Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARAP10276 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARAP10276 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARAP10276 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARAP10276 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARAP10276 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARAP10276 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RARAP10276 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARAP10276 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARAP10276 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARAP10276 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARAP10276 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RARAP10276 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARAP10276 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARAP10276 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARAP10276 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARAP10276 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARAP10276 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RARAP10276 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARAP10276 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RARAP10276 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARAP10276 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RARAP10276 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RARAP10276 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RARAP10276 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RARAP10276 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RARAP10276 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARAP10276 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARAP10276 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARAP10276 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARAP10276 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARAP10276 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RARAP10276 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RARAP10276 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARAP10276 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARAP10276 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARAP10276 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARAP10276 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARAP10276 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARAP10276 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARAP10276 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARAP10276 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARAP10276 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARAP10276 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARAP10276 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARAP10276 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARAP10276 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARAP10276 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARAP10276 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RARAP10276 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARAP10276 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARAP10276 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARAP10276 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARAP10276 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARAP10276 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARAP10276 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RARAP10276 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARAP10276 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARAP10276 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARAP10276 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARAP10276 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARAP10276 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARAP10276 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARAP10276 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARAP10276 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARAP10276 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARAP10276 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARAP10276 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARAP10276 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RARAP10276 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARAP10276 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RARAP10276 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RARAP10276 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARAP10276 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RARAP10276 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARAP10276 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARAP10276 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARAP10276 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARAP10276 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARAP10276 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARAP10276 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARAP10276 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARAP10276 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARAP10276 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARAP10276 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARAP10276 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARAP10276 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARAP10276 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARAP10276 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARAP10276 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARAP10276 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARAP10276 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARAP10276 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARAP10276 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARAP10276 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARAP10276 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARAP10276 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARAP10276 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RARAP10276 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARAP10276 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms