Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM236CP0DP71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
FAM236CP0DP71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms