Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF728P0DKX0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF728P0DKX0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF728P0DKX0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF728P0DKX0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms