Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM200BP0CF97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM200BP0CF97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM200BP0CF97 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM200BP0CF97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM200BP0CF97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM200BP0CF97 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms