Protein–RNA interactions for Protein: P0C7U9

FAM87A, Protein FAM87A, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM87AP0C7U9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM87AP0C7U9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM87AP0C7U9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM87AP0C7U9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM87AP0C7U9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM87AP0C7U9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM87AP0C7U9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM87AP0C7U9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM87AP0C7U9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM87AP0C7U9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms