Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
POLA1P09884 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
POLA1P09884 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
POLA1P09884 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
POLA1P09884 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
POLA1P09884 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
POLA1P09884 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
POLA1P09884 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
POLA1P09884 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
POLA1P09884 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
POLA1P09884 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.51■■■■■ 4.72
POLA1P09884 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
POLA1P09884 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
POLA1P09884 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
POLA1P09884 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
POLA1P09884 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
POLA1P09884 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
POLA1P09884 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
POLA1P09884 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
POLA1P09884 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
POLA1P09884 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
POLA1P09884 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
POLA1P09884 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
POLA1P09884 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
POLA1P09884 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
POLA1P09884 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
POLA1P09884 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
POLA1P09884 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
POLA1P09884 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
POLA1P09884 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
POLA1P09884 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
POLA1P09884 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
POLA1P09884 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
POLA1P09884 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
POLA1P09884 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
POLA1P09884 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
POLA1P09884 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
POLA1P09884 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
POLA1P09884 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
POLA1P09884 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
POLA1P09884 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
POLA1P09884 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
POLA1P09884 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
POLA1P09884 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
POLA1P09884 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
POLA1P09884 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
POLA1P09884 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
POLA1P09884 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
POLA1P09884 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
POLA1P09884 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
POLA1P09884 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
POLA1P09884 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
POLA1P09884 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
POLA1P09884 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
POLA1P09884 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
POLA1P09884 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
POLA1P09884 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
POLA1P09884 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
POLA1P09884 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
POLA1P09884 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
POLA1P09884 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
POLA1P09884 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
POLA1P09884 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
POLA1P09884 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
POLA1P09884 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
POLA1P09884 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.67
POLA1P09884 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
POLA1P09884 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
POLA1P09884 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
POLA1P09884 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
POLA1P09884 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
POLA1P09884 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
POLA1P09884 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
POLA1P09884 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
POLA1P09884 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
POLA1P09884 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
POLA1P09884 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
POLA1P09884 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
POLA1P09884 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
POLA1P09884 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
POLA1P09884 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
POLA1P09884 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
POLA1P09884 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
POLA1P09884 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
POLA1P09884 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
POLA1P09884 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
POLA1P09884 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
POLA1P09884 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
POLA1P09884 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
POLA1P09884 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
POLA1P09884 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
POLA1P09884 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
POLA1P09884 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
POLA1P09884 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
POLA1P09884 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
POLA1P09884 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
POLA1P09884 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
POLA1P09884 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
POLA1P09884 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
POLA1P09884 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 891.1 ms