Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB5P09067 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB5P09067 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB5P09067 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB5P09067 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB5P09067 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB5P09067 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB5P09067 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB5P09067 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB5P09067 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB5P09067 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB5P09067 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB5P09067 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB5P09067 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB5P09067 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB5P09067 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB5P09067 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB5P09067 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXB5P09067 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB5P09067 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB5P09067 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB5P09067 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB5P09067 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB5P09067 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB5P09067 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB5P09067 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB5P09067 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB5P09067 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB5P09067 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms