Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI1P08151 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI1P08151 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI1P08151 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI1P08151 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI1P08151 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI1P08151 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI1P08151 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI1P08151 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI1P08151 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI1P08151 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI1P08151 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI1P08151 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI1P08151 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI1P08151 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI1P08151 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI1P08151 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI1P08151 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI1P08151 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI1P08151 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI1P08151 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI1P08151 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI1P08151 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI1P08151 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI1P08151 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI1P08151 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI1P08151 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI1P08151 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI1P08151 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI1P08151 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI1P08151 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI1P08151 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI1P08151 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI1P08151 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI1P08151 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GLI1P08151 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI1P08151 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI1P08151 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI1P08151 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI1P08151 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI1P08151 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI1P08151 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI1P08151 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI1P08151 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI1P08151 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI1P08151 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI1P08151 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI1P08151 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI1P08151 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI1P08151 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI1P08151 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI1P08151 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI1P08151 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI1P08151 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI1P08151 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI1P08151 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI1P08151 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI1P08151 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI1P08151 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI1P08151 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GLI1P08151 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI1P08151 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GLI1P08151 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GLI1P08151 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GLI1P08151 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI1P08151 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI1P08151 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI1P08151 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI1P08151 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI1P08151 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI1P08151 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI1P08151 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI1P08151 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI1P08151 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI1P08151 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI1P08151 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI1P08151 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI1P08151 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI1P08151 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI1P08151 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI1P08151 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI1P08151 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI1P08151 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI1P08151 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI1P08151 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI1P08151 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI1P08151 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI1P08151 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI1P08151 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI1P08151 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI1P08151 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI1P08151 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI1P08151 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI1P08151 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI1P08151 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI1P08151 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI1P08151 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI1P08151 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI1P08151 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI1P08151 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms