Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP1P08047 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP1P08047 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP1P08047 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP1P08047 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP1P08047 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP1P08047 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP1P08047 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP1P08047 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP1P08047 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP1P08047 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP1P08047 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP1P08047 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP1P08047 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP1P08047 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP1P08047 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SP1P08047 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP1P08047 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP1P08047 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP1P08047 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP1P08047 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP1P08047 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP1P08047 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP1P08047 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP1P08047 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP1P08047 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP1P08047 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP1P08047 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP1P08047 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SP1P08047 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP1P08047 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP1P08047 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP1P08047 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SP1P08047 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP1P08047 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP1P08047 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP1P08047 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP1P08047 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP1P08047 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP1P08047 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP1P08047 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP1P08047 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP1P08047 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP1P08047 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP1P08047 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP1P08047 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP1P08047 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP1P08047 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP1P08047 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP1P08047 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP1P08047 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP1P08047 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP1P08047 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP1P08047 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP1P08047 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SP1P08047 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP1P08047 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP1P08047 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP1P08047 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP1P08047 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP1P08047 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP1P08047 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SP1P08047 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SP1P08047 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP1P08047 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP1P08047 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP1P08047 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SP1P08047 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP1P08047 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP1P08047 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP1P08047 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP1P08047 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP1P08047 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP1P08047 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP1P08047 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP1P08047 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP1P08047 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP1P08047 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP1P08047 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP1P08047 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP1P08047 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP1P08047 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP1P08047 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP1P08047 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP1P08047 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP1P08047 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP1P08047 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP1P08047 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP1P08047 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP1P08047 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms