Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB1P08034 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB1P08034 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB1P08034 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJB1P08034 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB1P08034 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB1P08034 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB1P08034 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJB1P08034 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJB1P08034 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJB1P08034 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB1P08034 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB1P08034 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB1P08034 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB1P08034 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB1P08034 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB1P08034 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB1P08034 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB1P08034 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB1P08034 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB1P08034 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB1P08034 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB1P08034 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB1P08034 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB1P08034 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJB1P08034 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJB1P08034 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB1P08034 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB1P08034 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB1P08034 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB1P08034 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB1P08034 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB1P08034 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB1P08034 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB1P08034 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB1P08034 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB1P08034 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB1P08034 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB1P08034 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB1P08034 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJB1P08034 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GJB1P08034 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB1P08034 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB1P08034 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB1P08034 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB1P08034 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB1P08034 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB1P08034 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB1P08034 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJB1P08034 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB1P08034 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB1P08034 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB1P08034 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB1P08034 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB1P08034 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB1P08034 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB1P08034 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB1P08034 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB1P08034 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB1P08034 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB1P08034 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB1P08034 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB1P08034 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB1P08034 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJB1P08034 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB1P08034 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB1P08034 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB1P08034 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB1P08034 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB1P08034 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJB1P08034 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJB1P08034 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJB1P08034 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJB1P08034 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB1P08034 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB1P08034 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB1P08034 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB1P08034 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB1P08034 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB1P08034 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB1P08034 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB1P08034 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB1P08034 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB1P08034 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB1P08034 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB1P08034 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB1P08034 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB1P08034 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB1P08034 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB1P08034 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB1P08034 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB1P08034 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB1P08034 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB1P08034 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB1P08034 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB1P08034 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB1P08034 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB1P08034 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB1P08034 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GJB1P08034 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms