Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFLP07196 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFLP07196 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFLP07196 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFLP07196 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFLP07196 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFLP07196 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFLP07196 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFLP07196 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEFLP07196 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEFLP07196 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEFLP07196 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEFLP07196 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEFLP07196 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEFLP07196 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEFLP07196 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEFLP07196 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEFLP07196 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEFLP07196 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFLP07196 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFLP07196 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFLP07196 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFLP07196 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFLP07196 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFLP07196 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFLP07196 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFLP07196 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFLP07196 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEFLP07196 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEFLP07196 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEFLP07196 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NEFLP07196 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEFLP07196 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEFLP07196 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEFLP07196 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEFLP07196 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEFLP07196 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEFLP07196 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEFLP07196 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEFLP07196 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEFLP07196 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEFLP07196 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEFLP07196 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFLP07196 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFLP07196 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFLP07196 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFLP07196 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFLP07196 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFLP07196 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFLP07196 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFLP07196 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEFLP07196 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEFLP07196 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEFLP07196 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFLP07196 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFLP07196 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFLP07196 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFLP07196 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFLP07196 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEFLP07196 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEFLP07196 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEFLP07196 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEFLP07196 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEFLP07196 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEFLP07196 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEFLP07196 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEFLP07196 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEFLP07196 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEFLP07196 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEFLP07196 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NEFLP07196 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NEFLP07196 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEFLP07196 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEFLP07196 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEFLP07196 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEFLP07196 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFLP07196 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFLP07196 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFLP07196 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFLP07196 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFLP07196 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFLP07196 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFLP07196 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NEFLP07196 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NEFLP07196 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NEFLP07196 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NEFLP07196 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NEFLP07196 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NEFLP07196 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NEFLP07196 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEFLP07196 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEFLP07196 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NEFLP07196 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NEFLP07196 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NEFLP07196 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms