Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPLP06858 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPLP06858 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPLP06858 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPLP06858 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LPLP06858 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPLP06858 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPLP06858 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPLP06858 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPLP06858 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPLP06858 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPLP06858 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPLP06858 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPLP06858 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPLP06858 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPLP06858 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPLP06858 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPLP06858 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPLP06858 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPLP06858 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPLP06858 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPLP06858 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPLP06858 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPLP06858 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPLP06858 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPLP06858 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPLP06858 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPLP06858 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPLP06858 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPLP06858 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPLP06858 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPLP06858 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPLP06858 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPLP06858 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPLP06858 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPLP06858 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPLP06858 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPLP06858 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPLP06858 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPLP06858 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPLP06858 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPLP06858 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPLP06858 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPLP06858 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPLP06858 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LPLP06858 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPLP06858 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPLP06858 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPLP06858 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPLP06858 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPLP06858 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPLP06858 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPLP06858 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPLP06858 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPLP06858 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPLP06858 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPLP06858 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPLP06858 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPLP06858 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPLP06858 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPLP06858 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPLP06858 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPLP06858 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPLP06858 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LPLP06858 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPLP06858 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPLP06858 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPLP06858 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPLP06858 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPLP06858 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPLP06858 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPLP06858 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPLP06858 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPLP06858 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPLP06858 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPLP06858 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPLP06858 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPLP06858 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPLP06858 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPLP06858 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPLP06858 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPLP06858 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LPLP06858 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPLP06858 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LPLP06858 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPLP06858 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPLP06858 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPLP06858 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPLP06858 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms