Protein–RNA interactions for Protein: P05814

CSN2, Beta-casein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN2P05814 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSN2P05814 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSN2P05814 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSN2P05814 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSN2P05814 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSN2P05814 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN2P05814 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN2P05814 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN2P05814 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN2P05814 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN2P05814 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSN2P05814 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSN2P05814 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSN2P05814 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSN2P05814 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSN2P05814 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSN2P05814 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSN2P05814 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSN2P05814 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSN2P05814 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSN2P05814 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSN2P05814 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSN2P05814 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSN2P05814 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSN2P05814 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSN2P05814 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSN2P05814 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSN2P05814 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSN2P05814 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSN2P05814 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSN2P05814 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSN2P05814 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSN2P05814 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSN2P05814 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN2P05814 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSN2P05814 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSN2P05814 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSN2P05814 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSN2P05814 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSN2P05814 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSN2P05814 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSN2P05814 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSN2P05814 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSN2P05814 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSN2P05814 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSN2P05814 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSN2P05814 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN2P05814 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN2P05814 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN2P05814 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN2P05814 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN2P05814 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN2P05814 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN2P05814 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN2P05814 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN2P05814 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN2P05814 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN2P05814 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN2P05814 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN2P05814 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSN2P05814 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSN2P05814 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSN2P05814 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSN2P05814 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSN2P05814 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSN2P05814 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSN2P05814 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSN2P05814 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSN2P05814 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSN2P05814 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSN2P05814 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSN2P05814 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSN2P05814 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSN2P05814 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSN2P05814 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSN2P05814 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSN2P05814 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSN2P05814 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSN2P05814 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSN2P05814 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSN2P05814 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSN2P05814 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSN2P05814 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSN2P05814 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSN2P05814 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms