Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM2P04554 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM2P04554 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM2P04554 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM2P04554 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRM2P04554 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRM2P04554 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRM2P04554 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRM2P04554 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRM2P04554 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRM2P04554 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRM2P04554 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRM2P04554 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRM2P04554 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRM2P04554 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRM2P04554 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRM2P04554 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRM2P04554 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRM2P04554 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRM2P04554 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRM2P04554 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRM2P04554 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRM2P04554 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRM2P04554 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRM2P04554 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRM2P04554 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRM2P04554 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRM2P04554 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRM2P04554 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRM2P04554 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRM2P04554 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRM2P04554 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRM2P04554 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRM2P04554 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRM2P04554 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRM2P04554 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRM2P04554 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRM2P04554 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRM2P04554 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRM2P04554 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRM2P04554 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRM2P04554 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRM2P04554 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRM2P04554 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRM2P04554 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRM2P04554 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRM2P04554 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRM2P04554 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRM2P04554 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PRM2P04554 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRM2P04554 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRM2P04554 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRM2P04554 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRM2P04554 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRM2P04554 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRM2P04554 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRM2P04554 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRM2P04554 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRM2P04554 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRM2P04554 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRM2P04554 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRM2P04554 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRM2P04554 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRM2P04554 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRM2P04554 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRM2P04554 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRM2P04554 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRM2P04554 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRM2P04554 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM2P04554 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM2P04554 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM2P04554 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM2P04554 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM2P04554 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM2P04554 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRM2P04554 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRM2P04554 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM2P04554 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM2P04554 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRM2P04554 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRM2P04554 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRM2P04554 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRM2P04554 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRM2P04554 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRM2P04554 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRM2P04554 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRM2P04554 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRM2P04554 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRM2P04554 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRM2P04554 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRM2P04554 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRM2P04554 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms