Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPB1P04440 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPB1P04440 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DPB1P04440 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms