Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THY1P04216 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THY1P04216 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THY1P04216 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THY1P04216 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THY1P04216 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THY1P04216 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THY1P04216 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
THY1P04216 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THY1P04216 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THY1P04216 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THY1P04216 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THY1P04216 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THY1P04216 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THY1P04216 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THY1P04216 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THY1P04216 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THY1P04216 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THY1P04216 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THY1P04216 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THY1P04216 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THY1P04216 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THY1P04216 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THY1P04216 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THY1P04216 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THY1P04216 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THY1P04216 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THY1P04216 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THY1P04216 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THY1P04216 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THY1P04216 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THY1P04216 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THY1P04216 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THY1P04216 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THY1P04216 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THY1P04216 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THY1P04216 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THY1P04216 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THY1P04216 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THY1P04216 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THY1P04216 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THY1P04216 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THY1P04216 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THY1P04216 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
THY1P04216 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THY1P04216 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THY1P04216 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THY1P04216 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THY1P04216 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THY1P04216 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THY1P04216 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THY1P04216 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THY1P04216 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THY1P04216 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THY1P04216 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THY1P04216 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THY1P04216 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THY1P04216 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THY1P04216 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THY1P04216 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THY1P04216 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THY1P04216 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THY1P04216 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THY1P04216 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THY1P04216 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THY1P04216 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THY1P04216 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THY1P04216 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THY1P04216 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THY1P04216 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THY1P04216 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THY1P04216 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THY1P04216 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THY1P04216 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THY1P04216 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THY1P04216 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THY1P04216 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THY1P04216 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THY1P04216 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THY1P04216 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THY1P04216 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THY1P04216 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THY1P04216 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THY1P04216 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THY1P04216 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THY1P04216 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THY1P04216 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THY1P04216 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THY1P04216 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THY1P04216 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THY1P04216 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THY1P04216 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THY1P04216 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THY1P04216 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THY1P04216 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THY1P04216 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THY1P04216 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THY1P04216 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THY1P04216 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THY1P04216 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms