Protein–RNA interactions for Protein: P02747

C1QC, Complement C1q subcomponent subunit C, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QCP02747 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QCP02747 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QCP02747 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QCP02747 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QCP02747 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QCP02747 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QCP02747 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QCP02747 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QCP02747 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QCP02747 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QCP02747 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QCP02747 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QCP02747 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QCP02747 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QCP02747 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QCP02747 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QCP02747 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QCP02747 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QCP02747 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1QCP02747 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QCP02747 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QCP02747 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QCP02747 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QCP02747 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QCP02747 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QCP02747 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QCP02747 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QCP02747 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QCP02747 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QCP02747 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QCP02747 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QCP02747 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QCP02747 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QCP02747 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QCP02747 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QCP02747 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QCP02747 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QCP02747 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1QCP02747 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QCP02747 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QCP02747 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QCP02747 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QCP02747 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QCP02747 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QCP02747 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QCP02747 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QCP02747 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QCP02747 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QCP02747 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QCP02747 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QCP02747 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QCP02747 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QCP02747 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QCP02747 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QCP02747 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QCP02747 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QCP02747 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QCP02747 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QCP02747 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QCP02747 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QCP02747 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QCP02747 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QCP02747 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QCP02747 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QCP02747 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QCP02747 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QCP02747 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QCP02747 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QCP02747 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QCP02747 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QCP02747 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QCP02747 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QCP02747 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QCP02747 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QCP02747 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QCP02747 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QCP02747 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1QCP02747 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QCP02747 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QCP02747 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QCP02747 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QCP02747 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QCP02747 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QCP02747 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QCP02747 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QCP02747 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QCP02747 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QCP02747 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QCP02747 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QCP02747 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QCP02747 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QCP02747 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QCP02747 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms