Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-9P01782 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHV3-9P01782 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-9P01782 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-9P01782 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.8 ms