Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTL6AO96019 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTL6AO96019 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTL6AO96019 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms