Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF12O95522 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF12O95522 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF12O95522 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRAMEF12O95522 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF12O95522 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF12O95522 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms