Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
SOGA1O94964 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.56■■■■■ 4.72
SOGA1O94964 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SOGA1O94964 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SOGA1O94964 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SOGA1O94964 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SOGA1O94964 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SOGA1O94964 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
SOGA1O94964 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SOGA1O94964 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
SOGA1O94964 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
SOGA1O94964 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SOGA1O94964 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
SOGA1O94964 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
SOGA1O94964 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SOGA1O94964 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
SOGA1O94964 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
SOGA1O94964 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
SOGA1O94964 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms