Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL18O94889 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL18O94889 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL18O94889 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL18O94889 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL18O94889 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL18O94889 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL18O94889 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL18O94889 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL18O94889 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms