Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CPDO75976 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CPDO75976 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPDO75976 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPDO75976 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPDO75976 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CPDO75976 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CPDO75976 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPDO75976 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPDO75976 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPDO75976 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPDO75976 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CPDO75976 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CPDO75976 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPDO75976 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPDO75976 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CPDO75976 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CPDO75976 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CPDO75976 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPDO75976 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPDO75976 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPDO75976 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPDO75976 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPDO75976 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPDO75976 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPDO75976 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPDO75976 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPDO75976 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPDO75976 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPDO75976 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPDO75976 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPDO75976 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CPDO75976 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPDO75976 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPDO75976 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPDO75976 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPDO75976 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPDO75976 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPDO75976 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPDO75976 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPDO75976 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPDO75976 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPDO75976 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CPDO75976 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CPDO75976 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPDO75976 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPDO75976 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPDO75976 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
CPDO75976 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CPDO75976 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CPDO75976 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CPDO75976 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CPDO75976 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPDO75976 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPDO75976 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPDO75976 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPDO75976 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPDO75976 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPDO75976 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPDO75976 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPDO75976 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPDO75976 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPDO75976 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPDO75976 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPDO75976 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CPDO75976 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CPDO75976 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CPDO75976 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CPDO75976 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CPDO75976 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CPDO75976 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CPDO75976 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CPDO75976 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CPDO75976 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CPDO75976 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CPDO75976 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPDO75976 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPDO75976 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CPDO75976 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CPDO75976 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CPDO75976 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPDO75976 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPDO75976 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CPDO75976 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CPDO75976 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CPDO75976 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CPDO75976 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CPDO75976 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPDO75976 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPDO75976 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPDO75976 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CPDO75976 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CPDO75976 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CPDO75976 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CPDO75976 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CPDO75976 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CPDO75976 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CPDO75976 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CPDO75976 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CPDO75976 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms