Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A1O75387 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A1O75387 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC43A1O75387 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms