Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRP5O75197 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRP5O75197 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRP5O75197 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRP5O75197 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
LRP5O75197 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRP5O75197 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
LRP5O75197 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRP5O75197 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRP5O75197 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRP5O75197 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LRP5O75197 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRP5O75197 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LRP5O75197 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LRP5O75197 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRP5O75197 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRP5O75197 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRP5O75197 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRP5O75197 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRP5O75197 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRP5O75197 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRP5O75197 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRP5O75197 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRP5O75197 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRP5O75197 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRP5O75197 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRP5O75197 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRP5O75197 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRP5O75197 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRP5O75197 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRP5O75197 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRP5O75197 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRP5O75197 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRP5O75197 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRP5O75197 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
LRP5O75197 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRP5O75197 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRP5O75197 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRP5O75197 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRP5O75197 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRP5O75197 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRP5O75197 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRP5O75197 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRP5O75197 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRP5O75197 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRP5O75197 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRP5O75197 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRP5O75197 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRP5O75197 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRP5O75197 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRP5O75197 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRP5O75197 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRP5O75197 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRP5O75197 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRP5O75197 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LRP5O75197 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRP5O75197 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRP5O75197 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LRP5O75197 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LRP5O75197 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
LRP5O75197 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LRP5O75197 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LRP5O75197 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LRP5O75197 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LRP5O75197 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRP5O75197 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRP5O75197 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRP5O75197 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRP5O75197 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRP5O75197 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRP5O75197 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRP5O75197 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRP5O75197 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRP5O75197 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRP5O75197 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LRP5O75197 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRP5O75197 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRP5O75197 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP5O75197 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP5O75197 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP5O75197 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP5O75197 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP5O75197 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP5O75197 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRP5O75197 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRP5O75197 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRP5O75197 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRP5O75197 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRP5O75197 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRP5O75197 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRP5O75197 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRP5O75197 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRP5O75197 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRP5O75197 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP5O75197 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP5O75197 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP5O75197 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP5O75197 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP5O75197 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP5O75197 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms