Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MSCO60682 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MSCO60682 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MSCO60682 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MSCO60682 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MSCO60682 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MSCO60682 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MSCO60682 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MSCO60682 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MSCO60682 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MSCO60682 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MSCO60682 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MSCO60682 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MSCO60682 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MSCO60682 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MSCO60682 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MSCO60682 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MSCO60682 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MSCO60682 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MSCO60682 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MSCO60682 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MSCO60682 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MSCO60682 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MSCO60682 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MSCO60682 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MSCO60682 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MSCO60682 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MSCO60682 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MSCO60682 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MSCO60682 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MSCO60682 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MSCO60682 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MSCO60682 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MSCO60682 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MSCO60682 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MSCO60682 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MSCO60682 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MSCO60682 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MSCO60682 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MSCO60682 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MSCO60682 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MSCO60682 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MSCO60682 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MSCO60682 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MSCO60682 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MSCO60682 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MSCO60682 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MSCO60682 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MSCO60682 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MSCO60682 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MSCO60682 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MSCO60682 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MSCO60682 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MSCO60682 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MSCO60682 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MSCO60682 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MSCO60682 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MSCO60682 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MSCO60682 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MSCO60682 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MSCO60682 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MSCO60682 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MSCO60682 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MSCO60682 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MSCO60682 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MSCO60682 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MSCO60682 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MSCO60682 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MSCO60682 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MSCO60682 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MSCO60682 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MSCO60682 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MSCO60682 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MSCO60682 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MSCO60682 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MSCO60682 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSCO60682 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSCO60682 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSCO60682 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSCO60682 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSCO60682 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MSCO60682 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MSCO60682 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MSCO60682 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MSCO60682 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MSCO60682 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSCO60682 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSCO60682 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSCO60682 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MSCO60682 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MSCO60682 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MSCO60682 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MSCO60682 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms