Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCM3APO60318 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCM3APO60318 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCM3APO60318 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM3APO60318 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM3APO60318 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM3APO60318 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms