Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SPAG9O60271 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SPAG9O60271 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SPAG9O60271 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPAG9O60271 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
SPAG9O60271 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SPAG9O60271 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SPAG9O60271 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SPAG9O60271 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SPAG9O60271 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SPAG9O60271 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SPAG9O60271 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SPAG9O60271 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SPAG9O60271 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms