Protein–RNA interactions for Protein: O43676

NDUFB3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB3O43676 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFB3O43676 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB3O43676 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFB3O43676 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB3O43676 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms