Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGOLN2O43493 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGOLN2O43493 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGOLN2O43493 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.2 ms