Protein–RNA interactions for Protein: O43390

HNRNPR, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPRO43390 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPRO43390 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPRO43390 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPRO43390 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HNRNPRO43390 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNRNPRO43390 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms