Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF1O43189 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF1O43189 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF1O43189 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF1O43189 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF1O43189 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF1O43189 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF1O43189 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF1O43189 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF1O43189 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF1O43189 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF1O43189 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF1O43189 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF1O43189 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF1O43189 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF1O43189 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF1O43189 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF1O43189 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF1O43189 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF1O43189 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF1O43189 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF1O43189 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF1O43189 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF1O43189 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF1O43189 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF1O43189 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF1O43189 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF1O43189 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF1O43189 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF1O43189 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF1O43189 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF1O43189 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF1O43189 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF1O43189 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF1O43189 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF1O43189 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF1O43189 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF1O43189 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF1O43189 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF1O43189 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF1O43189 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF1O43189 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF1O43189 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF1O43189 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF1O43189 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF1O43189 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF1O43189 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF1O43189 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF1O43189 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF1O43189 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF1O43189 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF1O43189 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF1O43189 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF1O43189 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF1O43189 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF1O43189 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF1O43189 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF1O43189 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF1O43189 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF1O43189 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF1O43189 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF1O43189 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF1O43189 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF1O43189 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF1O43189 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF1O43189 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF1O43189 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF1O43189 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF1O43189 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF1O43189 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF1O43189 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF1O43189 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF1O43189 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF1O43189 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF1O43189 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF1O43189 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF1O43189 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF1O43189 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF1O43189 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF1O43189 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF1O43189 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF1O43189 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF1O43189 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF1O43189 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF1O43189 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF1O43189 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF1O43189 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF1O43189 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHF1O43189 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF1O43189 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF1O43189 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF1O43189 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF1O43189 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms