Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHGDHO43175 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHGDHO43175 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHGDHO43175 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms