Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC5O15511 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARPC5O15511 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC5O15511 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5O15511 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms