Protein–RNA interactions for Protein: O15393

TMPRSS2, Transmembrane protease serine 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS2O15393 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS2O15393 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TMPRSS2O15393 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS2O15393 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS2O15393 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS2O15393 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS2O15393 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS2O15393 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS2O15393 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS2O15393 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS2O15393 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms