Protein–RNA interactions for Protein: O15014

ZNF609, Zinc finger protein 609, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF609O15014 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF609O15014 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF609O15014 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF609O15014 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF609O15014 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZNF609O15014 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF609O15014 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF609O15014 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF609O15014 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF609O15014 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF609O15014 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZNF609O15014 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms