Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKO14936 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKO14936 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKO14936 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKO14936 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKO14936 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKO14936 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASKO14936 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKO14936 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKO14936 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKO14936 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKO14936 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASKO14936 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKO14936 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKO14936 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASKO14936 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASKO14936 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASKO14936 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASKO14936 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASKO14936 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASKO14936 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASKO14936 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASKO14936 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASKO14936 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASKO14936 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASKO14936 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASKO14936 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASKO14936 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASKO14936 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASKO14936 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASKO14936 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASKO14936 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASKO14936 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASKO14936 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASKO14936 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASKO14936 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASKO14936 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASKO14936 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASKO14936 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASKO14936 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASKO14936 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASKO14936 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASKO14936 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASKO14936 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASKO14936 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASKO14936 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASKO14936 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASKO14936 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASKO14936 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASKO14936 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASKO14936 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASKO14936 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASKO14936 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKO14936 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKO14936 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKO14936 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASKO14936 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASKO14936 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKO14936 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKO14936 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASKO14936 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKO14936 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKO14936 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKO14936 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASKO14936 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKO14936 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKO14936 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKO14936 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASKO14936 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKO14936 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKO14936 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKO14936 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASKO14936 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASKO14936 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASKO14936 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASKO14936 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASKO14936 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASKO14936 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKO14936 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKO14936 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKO14936 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKO14936 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASKO14936 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKO14936 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKO14936 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKO14936 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKO14936 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKO14936 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKO14936 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKO14936 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKO14936 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKO14936 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKO14936 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKO14936 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKO14936 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKO14936 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKO14936 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKO14936 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKO14936 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKO14936 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms