Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RGPD8O14715 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD8O14715 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RGPD8O14715 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD8O14715 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RGPD8O14715 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RGPD8O14715 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RGPD8O14715 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms