Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB6O14558 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB6O14558 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB6O14558 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPB6O14558 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB6O14558 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms