Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BIN1O00499 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BIN1O00499 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BIN1O00499 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BIN1O00499 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BIN1O00499 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BIN1O00499 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BIN1O00499 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BIN1O00499 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BIN1O00499 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BIN1O00499 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BIN1O00499 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BIN1O00499 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BIN1O00499 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BIN1O00499 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIN1O00499 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIN1O00499 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BIN1O00499 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIN1O00499 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIN1O00499 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIN1O00499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIN1O00499 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIN1O00499 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIN1O00499 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIN1O00499 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIN1O00499 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIN1O00499 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIN1O00499 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BIN1O00499 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIN1O00499 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BIN1O00499 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIN1O00499 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIN1O00499 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIN1O00499 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIN1O00499 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIN1O00499 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIN1O00499 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIN1O00499 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIN1O00499 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIN1O00499 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BIN1O00499 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIN1O00499 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIN1O00499 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIN1O00499 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIN1O00499 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIN1O00499 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BIN1O00499 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BIN1O00499 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIN1O00499 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIN1O00499 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIN1O00499 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIN1O00499 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIN1O00499 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIN1O00499 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIN1O00499 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIN1O00499 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIN1O00499 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIN1O00499 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIN1O00499 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIN1O00499 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIN1O00499 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIN1O00499 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIN1O00499 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIN1O00499 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIN1O00499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BIN1O00499 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIN1O00499 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIN1O00499 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIN1O00499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIN1O00499 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIN1O00499 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIN1O00499 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIN1O00499 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIN1O00499 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIN1O00499 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIN1O00499 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIN1O00499 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIN1O00499 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIN1O00499 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIN1O00499 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIN1O00499 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIN1O00499 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIN1O00499 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIN1O00499 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIN1O00499 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIN1O00499 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIN1O00499 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIN1O00499 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIN1O00499 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms