Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA2O00451 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GFRA2O00451 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GFRA2O00451 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFRA2O00451 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms