Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DFFAO00273 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DFFAO00273 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DFFAO00273 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DFFAO00273 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DFFAO00273 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DFFAO00273 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DFFAO00273 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DFFAO00273 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DFFAO00273 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DFFAO00273 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DFFAO00273 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DFFAO00273 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DFFAO00273 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DFFAO00273 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DFFAO00273 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DFFAO00273 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DFFAO00273 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DFFAO00273 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DFFAO00273 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DFFAO00273 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DFFAO00273 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DFFAO00273 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DFFAO00273 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DFFAO00273 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DFFAO00273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DFFAO00273 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DFFAO00273 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DFFAO00273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DFFAO00273 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DFFAO00273 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DFFAO00273 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DFFAO00273 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DFFAO00273 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DFFAO00273 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DFFAO00273 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DFFAO00273 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DFFAO00273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DFFAO00273 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DFFAO00273 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DFFAO00273 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DFFAO00273 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DFFAO00273 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DFFAO00273 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DFFAO00273 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DFFAO00273 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DFFAO00273 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DFFAO00273 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DFFAO00273 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DFFAO00273 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DFFAO00273 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DFFAO00273 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DFFAO00273 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DFFAO00273 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DFFAO00273 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DFFAO00273 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DFFAO00273 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DFFAO00273 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DFFAO00273 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DFFAO00273 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DFFAO00273 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DFFAO00273 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DFFAO00273 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DFFAO00273 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DFFAO00273 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DFFAO00273 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DFFAO00273 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DFFAO00273 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DFFAO00273 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DFFAO00273 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DFFAO00273 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DFFAO00273 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DFFAO00273 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DFFAO00273 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DFFAO00273 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DFFAO00273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DFFAO00273 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DFFAO00273 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DFFAO00273 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DFFAO00273 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DFFAO00273 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DFFAO00273 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DFFAO00273 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DFFAO00273 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DFFAO00273 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DFFAO00273 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DFFAO00273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DFFAO00273 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DFFAO00273 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DFFAO00273 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DFFAO00273 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DFFAO00273 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DFFAO00273 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms